В Историческом отделе экспозиции включают в себя разные исторические временные периоды от Древней истории Алтая до сегодняшних дней. Здесь можно увидеть саркофаг, котел, оружие из скифских курганов, предметы культа алтайских шаманов; оригинальное искусство старинного художественного литья из чугуна, буддийской скульптуры; коллекции часов и самоваров; уникальные образцы холодного и огнестрельного оружия, в том числе пехотное кремневое ружье образца 1808 года, произведенное на Ижевском оружейном заводе в 1824 году. Кол­лекция Алтайских петроглифов насчитывает более 300 картин разных эпох, различ­ных сюжетов, разнообразных стилей и техники.