Вологодский государственный музей-заповедник является научно-исследовательским и научно-просветительским учреждением, государственным хранилищем художественных, историко-архитектурных, литературных и других памятников материальной и духовной культуры, а также природы.
Объектами музейного показа являются более 40 памятников архитектуры общей площадью более 9000 кв. м. Ежегодно музей посещают около 200 тысяч человек; строится более 40 экспозиций и выставок по различной тематике; проходят международные и всероссийские научные конференции, практические семинары по различным направлениям музейной деятельности.
В настоящее время Вологодский музей-заповедник состоит из комплекса памятников Вологодского кремля, а также 8 филиалов. В Вологодском кремле открыта экспозиция «Природа и история Вологодского края», залы Художественного отдела и выставочные залы Юго-Западной башни.