Санкт-Петербургский музей Хлеба был создан в 1988 году как ведомственный объединения «Ленхлебпром» в здании хлебозавода «Лиговка» и носил название «Музей истории хлебопечения». Это первый музей Хлеба в России.

25 декабря 2015 года музей переехал в новое здание по адресу: ул. Михайлова, д. 2 литера А. Здание, в котором музей сегодня располагается, является памятником деревянной городской архитектуры Санкт-Петербурга первой половины XIX века. Построен дом был в 1827-1829 годах по проекту архитектора Мартына Ливена для почетного гражданина Санкт-Петербурга И. А. Пастухова.

Бывший дом И. А. Пастухова — двухэтажное здание в семь окон, второй этаж которого деревянный. До сегодняшнего дня в его интерьерах сохранились керамические печи, лепнина, росписи плафонов. Среди изразцовых печей дома заметно выделяется богатством рельефного декора печь, облицовка которой изготовлена на Тверской фабрике Товарищества производства фарфоровых и фаянсовых изделий М.С. Кузнецова.

В залах этого здания сегодня располагается экспозиция Санкт-Петербургского государственного бюджетного учреждения культуры «Санкт-Петербургский музей Хлеба».

Экспозиция представляет период от освоения сельскохозяйственных культур на Руси до настоящего времени. Главный акцент в экспозиции сделан на показе производства, продажи и потребления хлеба в Санкт-Петербурге на протяжении трех столетий.

Свои двери для посетителей сегодня открывают двенадцать залов постоянной экспозиции музея и выставочные пространства.