Постоянная экспозиция музея состоит из 5 разделов, отражающие природно-климатические зоны, и из 3 уголков - это уголок гербарий с лекарственными растениями, уголок с насекомыми-бабочками и жуками, уголок с разными окаменелостями-аммонитами, минералами и аквариумом с рыбками.

Одной из важных задач в построении экспозиции музея являлось ознакомить посетителя с богатейшей флорой и фауной нашего региона.

Музей представляет вниманию посетителей экспозицию в виде разделов, которые отражают природно-климатические зоны Южного Дагестана. В музее экспонируется чучела животных, птиц и представителей водного мира, среди которых есть виды, занесенные в красную книгу.

Позиционирует себя как структурное подразделение, осуществляющие историко-краеведческую работу и включающее направление краеведения Прикаспия.